Personalmente intento no utilizar los atenuadores de previos ni de los micros. En la batería y otros instrumentos se hace imposible a veces porque algunos previos comienzan con una ganancia mínima bastante alta.
Lo que comentas no debería suceder a no ser que el pad por alguna razón reste frecuencias altas.
Prueba a subir esas frecuencias, seguramente por encima de los 12 Khz. en las tomas con pads y seguramente se te restaure ese deseado ambiente.
Pues he comprobado ya en varios micrófonos que la atenuación cambia un pelin el color. Así que en la medida de lo posible mi consejo es que no los utilices.