Si vas a usar tu disco en Mac y Win tienes que formatear en WIN NTFS mejor que FAT32 porque Mac reconoce sus propios formatos de disco como es logico (Mac OS plus con o sin registro) y también los de WIN Fat32 y NTFS. Si embargo WIN para poder ver los disco en formato de MAC necesita aplicaciones adicionales.
En la carpeta utilidades del MAc tienes la Utilidad de discos que te permite formatear en todos los sistemas de archivos conocidos, incluidas configuraciones en RAID. Con Utilidad de discos tambien puedes crear particones como mejor te venga: por ejemplo 1 en MAc OS Plus y otra en Win.
puedes formatear el dico duro en HFS para que funcione con mac, y luego instalarte el Macdrive en el Pc para que te lo reconozca windows. Tambien podrias hacerlo al reves ya que tambien hay un Kext que te permite leer NTFS en Mac. Saludos