¿A qué te refieres con configuar el micro? Según comentas vas a grabarla por línea, ¿me equivoco?
Si la grabas por línea, no tienes que configurar nada del micro. Para que suene bien pues, es muy subjetivo. Sobre todo en primera instancia dependerá de las manos del guitarrista, de la calidad de la guitarra, de las pastillas, de los pedales que uses (si es que usas), de la calidad de los cables, y una vez grabada, si necesita ecualización, compresión, efectos dinámicos (delay, reverb, phaser...) dependerá de la canción y de lo que quieras conseguir. No hay un método fijo para que "suene bien", dependerá del estilo, de lo que quieras conseguir, y sobre todo de la experiencia que vas teniendo a medida que grabas y grabas y grabas y mezclas y mezclas...
Hombre, hay mucha literatura al respecto. Puedes buscar por foros, tutoriales, páginas web, libros, dvd's etc. Por ejemplo, se me vienen a la mente los dos cursos de mezcla y masterización en libro y DVD de Steinberg en los que da muchos consejos y están bastante bien.
el adobe.. tiene muchas funciones..por ejemplo el adobe audition 2 cunta con un compresor de izotope.. que te puede dar muy buena calidad ala guitarra y manejar el sonido deseado.... tambien cunta con equalizadores graficos que te pueden ayudar a manipular las frecuencias....de alli en adelante poes masnejas los efectos como reverb delay etc...y si ya quisieras algo mas superior te recomendaria los plugin de waves... espero y te aayude