A día de hoy, es mucho más fácil que todo eso. Con Studiomux tienes MIDI y audio con calidad digital bidireccional entre iPad y ordenador, sin necesidad de interfaz, usando únicamente el cable dock/lightning:
http://midimux.com/
https://www.hispasonic.com/tutoriales/midimux-audiomux-paso-paso/40331
Si tu SO no es compatible con el streaming de audio o si quieres grabar audio en el ipad sin ordenata por medio, entonces sí necesitas una interfaz.
Por otro lado, si no necesitáis grabar en tiempo real, podéis simplemente exportar los archivos de audio entre uno y otro sistema. Gadget exporta tus proyectos en audio, por ejemplo (a través de iTunes y Dropbox por lo menos, creo recordar). Otras apps que no lo hacen directamente sí son compatibles con Audiobus, que os permite rutear el audio dentro del iPad a una tercera app como Audiocopy o Audioshare, en la que grabar y desde la que exportar el archivo de audio.
Y al revés, para pasar un archivo de audio del PC al iPad seguramente baste con exportar el archivo de audio a la app del iPad, usando iTunes u otra variedad de métodos (dropbox, mail) que la app de destino puede admitir.
Sortear la salida de auriculares siempre os dará mayor calidad, aunque en efecto basta con conectar la salida de auriculares a la tarjeta de audio usando un cable de minijack estéreo a doble jack mono para grabar el output de audio de la forma más tradicional.
Y para grabar en el iPad, siempre que tu tarjeta de audio sea Core Midi Compatible, conectarla al iPad usando un "camera adaptor" (adaptadores de usb a dock/lightning). Yo por ejemplo he usado una de esas chiquititas UCA de Behringer (valen como 30 euros...) con el adaptador oficial, y me fue fenomenal, pero puestos a considerar algún otro hard, miraros las de iConnectivity, que brindan el mismo tipo de bidireccionalidad de Studiomux.