Hola,
Si no me equivoco, tu interfaz tiene dos entradas; por qué no conectas un micro a cada entrada de la interfaz y pasas de la mesa? Así podrías grabarlo en dos pistas en tu protools, indicándole a cada pista su canal de entrada de la interfaz respectivo.
Hola dramatictone, no hago lo que me comentas porque a una de las dos entradas de la interfaz voy a conectar otro micro y a la otra entrada de la interfaz sería donde va la salida de la mesa.
Pues entonces, que yo sepa no hay forma... Si la salida de la mesa va a una única entrada, se graba lo que registre esa entrada... A no ser que esa tarjeta tenga alguna que otra entrada más o alguna triquiñuela, cosa que desconozco... Siento no poderte ser de más ayuda...