Hola. Yo uso los dos tambien (FL y R5). No soy ningún experto, pero te puedo decir que puedes combinarlos de varias formas. Lo más fácil es usar R5 como instrumento vst en FL, cargas un ensemble en reaktor y listo, lo usas como si fuera otro instrumento más. Pero puedes usarlo de otros modos. A mi me gusta insertar un edison a la salida de reaktor para grabar loops, trocearlos y arrastrarlos a un slicer, por ejemplo. Es súper rápido e intuitivo...
Si quieres manipular un metaphysical function desde FL necesitarás insertar un MIDI out o un Dashboard para controlarlo (que yo sepa). Tambien puedes mandar cambios de programa desde FL para ir cambiando de snapshot en el ensemble de Reaktor, por ejemplo.
En resumen, puedes combinarlos como quieras. No creo que haya un tutorial específico de los dos, pero si te pasas por los foros de ambos programas seguro que encuentras información con que inspirarte...
espero que te sirva de ayuda, si necesitas información más específica no dudes en preguntar.