Hola amigo,.. me parece q la solucion a tu problema es sencilla...
Seguramente la configuracion del audio en tu placa esta mal...
Si tienes windows xp o vista... Fijate en panel de control, dispositivos de sonido y audio, y en la solapa de volumen tienes propiedades avanzadas...
Click ahí,.. opciones avanzadas,.. de ahi en la nueva ventana, opciones, propiedades..
Ahi te muestra tu dispositivo mezclador, en reproduccion destilda entrada de linea y microfono, tildandolos solamente en grabacion.
Fijate si solucionas y avisá...
Exitos!