Me ha pasado dos veces, haciendo probatinas, he podido comprobar, la primera no muy segura, la segunda vez ya, he echo una personalización completilla de la barra de transporte, he salido de Logic y he vuelto a entrar para asegurarme de que no me equivocaba, y no me ha mantenido dicha configuración.
He leido el apartado sobre la barra de transporte en el manual, pero no he encontrado que dijeran si se mantiene de una vez a otra.
Supongo que debería guardarla, por que si no... tener que volver a poner los mismo cada vez...