Hola: No uso el Musescore y por ello no soy ni mucho menos un experto, pero como nadie te contesta voy a ver si puedo ayudarte.
Abre el menú "Mostrar" y marca la opción "Panel de Reproducción". Aparece la ventana MuseScore: Play Panel. En la parte inferior de esa aventana hay una barra de desplazamiento horizontal y dos filas de números encima de ella. La fila superior indica el número de compás, y el pulso del mismo, en el que se iniciará la reproducción. Mueve la barra desplazamiento hasta que aparezca el número de compás en el que quieres empezar y listo.
Espero haberte ayudado. De todas formas seguro que hay por la red foros de Musescore en los que te podrán ayudar más y mejor.
Saludos.
pues te instalas la nueva version, la 1.0 y colocas el cursor donde quieras empezar y pulsas la barra espaciadora. en versiones anteriores a mi me pasaba lo mismo