Hola, yo haría un par de cosas, primero instalo "solamente" el disco que da problemas aunque no tenga sistema operativo instalado, quiero comprobar si la BIOS lo acepta y punto, mientras arranca el ordenador le das repetidas veces a F2 y la tecla SUPR, de esa manera sale en imagen la BIOS por lo general en azul y blanco, si aparece en pantalla el disco "electricamente" funciona, otra cosa es que tenga sectores defectuosos o algún otro problema.
Segunda prueba, con el disco "bueno" lo arrancas cambiando de conector de datos SATA puede tener de 2 conectores a 6, arranque de ordenador en base SATA0 si va bien pasas a la siguiente, de esta forma descartamos que las bases funcionen "todas" bien.
Tercera prueba, el problema puede ser el cable de datos, "el angosto casi siempre de color ROJO o NEGRO", sabemos que el cable del disco "bueno" sirve, bien cambiá de cable con el otro disco y arrancá a ver que pasa, de esta manera descartamos que el cable está bien.
Cuarta prueba, borrar la BIOS, a veces sin darnos cuenta cambiamos algo en el arranque (por ejemplo que solamente vea 1 disco duro) y te podés pasar toda una vida intentando meter otro y no va a suceder eso nunca, la BIOS la borras sencillamente, sacás la bateria (redonda de 3 volt) y desenchufas el cable de corriente que va a la fuente de alimentación del PC, agarrás un destornillador de base plana y cortocircuitás la base donde estaba la batería, es decir que el destornillador toque el centro y el costado de la base o sea que toque en el positivo (centro) y negativo (costado) durante unos 10 a 15 segundos, eso hará que la BIOS arranque en modo "predeterminado", de esa manera sabremos si hemos metido la pata con la configuración del arranque del ordenador.....ok? SUERTE....!!!!!!!!!!!!!!!!