Hola:
El Usb lo tienes para conectar el POD al ordenador, no a la guitarra.
El POD tiene incorporada una tarjeta de sonido, y al conectar el POD por usb al ordenador estas utilizando esa tarjeta de sonido para grabar.
Sobre tu pregunta de si suena mejor por usb (tarjeta del POD) o por la tarjeta de tu ordenador, pues va a depender de que tarjeta este utilizando en tu ordenador. Si tienes una sound blaster o algo del estilo yo te recomendaria que usases el POD por usb, suena bastante bien.
Si tienes una tarjeta mejor pues haz la prueba, graba algo con la del pod y algo con la tarjeta del ordenador a ver que es lo que gusta mas.
Un Saludo
Con la conexión USB lo único que haces es usar la POD como tarjeta de sonido como ya te explicaron, pero igual para poder escuchar, necesitas conectar los audífonos a la POD o algún monitor directo a ella.
Sólo con la conexión USB no escucharás nada por el ordenador, tienes que conectar monitoreo directo a la POD.
Saludos