NO debería haber ningún problema, aunque tienes que revisar que las dos tarjetas no estén compartiendo recursos (creo ques estos se llaman IRQ).
Prueba cambiando la Audiophile de slot. Cómo tienes configurados en el panel de control tus dispositivos de audio????
También puedes probar inhabilitando la soundblaster en panel de control-dispositivos de audio-hardware-propiedades, a ver si mejora la Audiophile. Luego la puedes volver a habilitar.
Lo ideal sería que configuraras la Audigy para que reproduzca los sonidos de windows y la Audiophile sólo para trabajar con los secuenciadores.
Saludos