Claro hombre, file -> export -> midi file, o algo parecido, claro que se puede, lo unico que tendras que aplicar todos los parametros de cada pista, en un menu hay una opcion que dice algo asi como "insert instrument settings as events", selecionando todas las pistas, y asi tendras tu midifile con todos sus parametros.
En mi Logic 5.5, para PC, se hace simplemente eligiendo la opción de "exportar". Desde ahí te dan la opción de hacerlo como MIDI.
Saludos