Pues no uso FL, pero supongo que se hará como con cualquier otro VSTi:
Pones los localizadores "L" y "R" al principio y fin del tema o pista, respectivamente.
Vas a Archivo > Exportar, y exportas como pista de audio.
En algún momento te da la opción de cargar la pista resultante como una pista de audio más en el arreglo de Cubase.
NO hay una forma mas directa, como por ejemplo hacerlo en tiempo real a medida que reproduce, porque quiero yr modificando los loops a medida que se graba.
Gracias, Jordi , es que no he especificado para que era, el metodo explicado ya lo sabia.