Entre el USB 1.1 y el 2.0 la diferencia está en que el 2.0 es más reciente y tiene mayor tasa de transferencia de datos, es decir la cantidad de KB por segundo que es capaz de manejar. Cuanto mayor sea mejor.
La del USB 1.1 es de hasta 12 Mbps (1,5 MB/s) y el 2.0 de hasta 480 Mbps (60 MB/s).
Actualmente se está trabajando en el USB 3.0.
El firewire tiene otro conector distinto al de los USB, pero tiene usos similares. Su tasa de transferencia para el firewire 400 es de 400 Mbps.
Actualmente también hay el firewire 800 con unos 786,5 Mbps, pero no sé si existen muchos aparatos ya que implementen y aprovechen este nuevo firewire.
Las diferencias fundamentales entre USB y firewire radican en que aunque el USB 2.0 tiene una mayor tasa de transferencia teórica que el firewire 400 (aunque no mucha más), este último es mucho más estable en cuanto a que ofrece siempre tasas cercanas al máximo a diferencia del USB que fluctua mucho más. Por lo que en principio para audio es más recomendable el firewire, aunque si va por USB tampoco vas a tener problemas (mi tarjeta de sonido es USB 2.0 y estoy encantado con ella).