Incluso una tarjeta integrada de medio pelo es capaz de grabar hasta unos 18 khz, de manera que en alguna parte algo está fallando.
Toma una canción sin comprimir (wav o flac) y con un EQ corta todo por encima de 10 khz, deberías notar la diferencia con y sin esas frecuencias....
Qué equipos y programas usas?
has probado a cargar una pista, de esas de musica que externamente al secuenciador dan información por encima de 10khz, si lo haces y no reproduce por encima cuando la cargas, el problema esta en el secuenciador que tiene algun filtro activado.
si lo haces y reproduce igual que el itunes, windows media player, etc... entonces el problema esta en lo que grabas y no en el secuenciador, tendras k analizar la cadena de entrada, ahora un paso bajo, que cosa mas rara...