Bueno, fue complicado, pero encontré una manera de conseguirlo. Lo posteo por si a alguien le puede interesar hacer lo mismo, o si quiere contribuir explicando algún otro método.
Sabía que hacía unos meses se planteó algo muy parecido en el foro Effects de kvr, en el que incluso contribuí dando una pista falsa
porque entonces me pensaba que Chainer permitía hacerlo.
http://www.kvr-vst.com/forum/viewtopic. ... 491#426491
Lo que ocurre es que Amplitube no acepta mensajes MIDI de cambio de programa.. Brainspawn Forte (creo) o DTPlayer combinados con Amplitube sí permiten hacerlo, pero funcionan como programa independiente y yo quería un plugin. Estos programas serían útiles por ejemplo para cambiar los presets en un pc portátil desde una pedalera MIDI, para directos.
La solución a todo esto se llama Console, de Art Teknika (una empresa japonesa), tal como dice el topic de kvr. Puede funcionar como plugin de efecto VST y permite insertar todo tipo de configuraciones de efectos VST (también VSTis, para crear por ejemplo texturas más gruesas combinando varios sintes). Cargas este plugin en la pista de guitarra, lo configuras insertando Amplitube en la ruta de audio y en la ruta MIDI y asignas el controlador MIDI que quieras al cambio de presets. Podéis verlo en una capturita que adjunto. Luego sólo hay que crear una nueva pista MIDI, con Console en MIDI out, & insertar manualmente mensajes MIDI Control Change para alternar entre los cuatro posibles memorias que aparecen por defecto (lo que no consigo por el momento es añadir nuevos presets y que queden guardados, pero 4 ya es suficiente para mi).
En fin, que me extraña no haber recibido respuestas o no haber podido localizar más info sobre esta cuestión, ya que en principio parecería lógico que Cubase lo incorporara como función propia, o el propio Amplitube.. tratándose en este caso de un ampli virtual/multiefectos pues lo más normal sería poder alternar presets fácilmente.