Creo ( si no me equivoco ) que la unica version de melodyne que funciona en Protools es Melodyne essential (al menos ese ha sido mi caso).
Lo que tienes que hacer, es borrar o mover el plugin fuera del folder donde estan los plugins de protools.
Dirigete al folder C:\Program Files (x86)\Common Files\Digidesign\DAE\Plug-Ins (windows 7, en XP sera dentro de program files...) y quita los archivos Melodyne plugin.dpm y Melodyne plugin.dpm.rsr y colócalos en el siguiente folder: C:\Program Files (x86)\Common Files\Digidesign\DAE\Plug-Ins (Unused) ó puedes borrarlos, porque lo mas probable es que no te sirvan de nada.
Así tienes que hacer con cualquier otro plugin que impida a Protools cargar por completo. Si no lo haces, entonces no podras usarlo.
Millones de Gracias amigo Joaquin, no sabes de verdad como agradezco tu atención y que te hayas tomado la molestia de apoyar al prójimo... seguí al pie de la letra tus instrucciones y funcionó perfectamente..... te reitero mi agradecimiento... estás bárbaro en pro tools.... millones de bendiciones....