hola...
no sé si estás bajando midis de la web e importándolos a tu DAW...pero si es así, se me ocurre una posible causa para tu problema: generalmente se reserva el primer compás de la secuencia para grabar los eventos midi que van a asegurar una reproducción correcta del archivo (número de instrumento, volumen, fade ins- fade outs, controladores etc...) es por eso que aunque hayas hecho cambios al archivo una vez le des stop y vuelvas al comienzo, los cambios que hayas hecho se perderán ya que el secuenciador vuelve a leer las instrucciones del primer compás...una solución por lo fácil (si este es el caso) sería hacer los cambios necesarios y empezar la reproducción desde el compás 2 de modo que el secuenciador ignorará la información original....o lo realmente práctico sería que eliminaras la información midi implantada y la reemplaces con la tuya.
saludos...espero que sea de ayuda.
o ir al menú MIDI>lista de eventos y borrar el mensaje relativo al volumen
eso mismo under...
saludos.