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¿Que tipo de click?.
Si es tipo "digital" o tipo "pop", puede ser sobrecarga de la cpu, por un pico de actividad o algo parecido, si es otro click que afecta al audio, tal vez estés activándolo en un transitorio y con un poco de resonancia pueda estar saturando.
no de sobrecarga no es es mas lo que comentas lo segundo, antes de que venga el break lo activo y se ve q ue coge algun transitorio y se escucha mal, y a veces no se como solventar el problema.