Hola, como en cualquier aplicacion de audio hay que ecualizar cada pista individualmente para intentar que cada una ocupe su espacio dentro del espectro de frecuencias, y siempre es preferible quitar antes de poner.
Luego si quieres puedes ecualizar el master para corregir la sonoridad general.
Salu2
Hay que ver la ecualización como un proceso para corregir o realzar cierto instrumento, de manera que depende de lo que se necesite. muchos tienen como regla meter un highpass filter a 80 Hz a todos los tracks menos los del bajo y el bombo, para que haya mas aire en las frcuencias bajas, de esa misma manera se ecualizan los demás tracks: según sea necesario.
Yo lo que hago es dejar sonando cada track lo mejor posible (consulta en internet que hay muchas fuentes de como ecualizar cada instrumento) que luego en la masterización me encargo del sonido en conjunto.