Hola, Hernan, bienvenido al foro.
Puedes definir el porcentaje de las partichelas desde el menú
Document/Manage Parts/Part Creation Preferences/Page Format for Parts. En esa ventana puedes cambiar la orientación, el tamaño, el %, los márgenes de pentagrama, la distancia entre sistemas, etc. En
Part Creation preferences también puedes fijar un número de compases por sistema. Cuando lo tengas, das OK, Generate Parts, y de nuevo OK. En esta página hay un
plu-gin (Copy Part Layout) que permite copiar la maquetación entre partichelas.
http://www.finaletips.nu/index.php/download/category/9-plug-ins-for-windows
Saludos