Para evitar eso, deberias hacer el loop con un editor de audio y no desde el playlist (Puedes hacerlo desde el mismo Edison que lleva el FL, o desde un programa aparte como audacity...).
Para crear el loop y que suene sin "clipeos", recomiendo seccionar el sample por donde la onda cruza justo por el centro, siempre en el mismo sentido (cruce de a bajo a arriba en AMBAS SECCIONES, o viceversa, cruce de arriba a bajo en AMBAS SECCIONES):
(ejemplo de loop muy corto)
Además, te recomiendo que te grabes el loop almenos 3 veces. Así pues tendrás 3 partes que melódicamente serán identicas (suponemos un mismo riff), pero que tendrán matices distintos en grabación... Así pues grabaremos 3 veces el riff y lo dividiremos igualmente en 3 partes: la 1a te servirá de inicio, de modo que la primera nota te sonará limpia, es decir, sin ningún tipo de rastro a causa de ninguna nota anterior. La 2a te servirá para hacer el loop tantas veces como quieras y la 3a te servirá para finalizar, para que puedas dejar caer la nota final hasta cuando quieras... así que cuando grabes deja sonar indefinidamente la última nota... luego ya la cortarás (con un fade out por ejemplo).
A ver si puedo ponerte un ejemplo: un riff que dura 8 compases:
grabamos el SAMPLE: 1 - 2 - 3. (el sample tiene solamente 3 compases de el mismo riff)
montamos la CANCIÓN: 1 - 2 - 2 - 2 - 2 - 2 - 2 - 3. (en la canción hemos rellenado en medio hasta 6 veces con el segundo riff del sample).
