Hola, todos los DAW's como ProTools suelen tener un apartado de PREFERENCIAS de audio/midi, donde puedes encontrar ese tipo de cosas. Echa un vistazo en el manual o plantea la cuestion en el foro de Protools (indicando que version) Saludos
Desde el panel de control puedes colocar la interfaz a 128 samples de latencia, posteriormente en el DAW el por defecto cargará los 128 samples de latencia que has colocado en el panel de control de la interfaz, será normal que haga clicks o crackles si tu procesador no es potente, aclaro, en grabación, este buffer es bien (pero con percusión molesta un poco), si puedes trabajar con valores inferiores como 64 o 32 pues lo haces, pero depende de tu procesador, interfaz, memoria ram y demás, posteriormente en la mezcla puedes subirlo a 1024 o superior ya que no es necesario que tenga poca latencia (a no ser que estés usando outboard o hardware para que retorne al DAW) así tu procesador en la mezcla trabajará ''mas relajado''
Salud y saludos