La CPU al 100% en un momento ¿por que?

Todo ha empezado por actualizar un programa (no de música).
Desde ese momento todo va lento y a "trompicones", como que le cuesta hacerlo todo.

Total que en el Administrador de Tareas de Windows avisto que sólo con darle al botón Inicio de Windows y pasando el ratón por el menu de programas la CPU se pone al máximo en un momento.

Tengo el RocketDock y lo mismo, es pasar el ratón por encima y el procesador para que le vaya a dar un infarto !!!

He borrado el programa que lo ha ocasionado todo pero continua igual.
He pasado el TuneUp Utilities 2006 a ver si así podia conseguir un mejor rendimiento y na de na !!!
He iniciado el sistema unas cuantas veces a ver si volvia a la normalidad pero tampoco.
He pasado el antivirus y programas spyware y similares y no encuentra nada, todo correcto.

Lo único que me queda es formatear pero me gustaria evitar esto como fuese !!!
¿Sabeis que le puede estar pasando a mi máquina?
¿Algun consejo a probar?

Muchas gracias.

P.D. Con todo esto he descubierto que no tengo activado el Hyper Threading, como puedo habilitarlo?

en el propio administrador de tareas has de ver en procesos las aplicaciones que estan tabajando y consumiendo cpu,intenta de entre todas averiguar cual es la sospechosa para identificarla,detenrla y buscar una solucion,creo que no te haga falta formatear,prueba con el spiboot destroy para localizar algun robot que se halla colado y este trabajando e tu sistema sin tu verlo tu.

querras decir que solo ves el proceso de un nucleo en el administrador de tareas, mira en las obciones -ver- en el administrador de tareas para ver la grafica de los dos nuleos del hiper treading,me estraña mucho que lo tengas desactivado para activarlo habras de entrar en -bios setup-

Explorer.exe es el que se pone a 100 al pasar el raton por el menu inicio/programas y bueno, cualquier programa grande ya tarda un rato largo en abrirse, hasta MiPC y MisDocumentos tardan lo suyo en abrirse.

El Spybot Search & Destroy tambien lo he pasado y no encuentra y na y esta actualizado

El HT voy a verlo ahora mismo en la Bios.

Gracias !!!

¿Has probado a restaurar el sistema a una fecha anterior a la actualización de ese programa?