En teoría no debería haber diferencia alguna, y esto es fácilmente comprobable. Utiliza un softsinte en FL y exportalo, utiliza ese mismo en otro secuenciador (cubase, logic, sonar, Live), ahora pon los dos en una misma sesión y diríjelos a un mismo bus de salida, ya sea en FL o en otro, y cámbiale la fase a uno.
Los dos deben estar en condiciones similares, por cierto.
Si las muestras son iguales, se cancela el sonido, no se escucha sonido alguno, con la cual quda demostrado que no hay diferencia.
Si se escucha aunque sea un poco, entonces es verdad.
ojo, hay que tener las dos muestras en iguales condiciones, cuidado con la latencia
Saludos
hurm