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De poder se puede, pero lo ideal seria usar herramientas mas especificas para ese proceso tan delicado, como el Wavelab por ejemplo, en Hispa existen varios post sobre masterización buscalos y se te serviran.
Saludos
Yo masterizo con ozone 3 y no queda mal, tiene 6 herramientas, equalizador paragrafico, reverd de masterizacion, maximizador y dither, excitador multibanda, compresor multibanda y ampliador de imagen estereo multuibanda. ademas sus manuales estan faciles de entender, y todo esta claro.
PROTOOLS SIMPLEMENTE TE SERVIRIA DE SOPORTE PARA TRABAJAR LA ONDA DE RESTO ES APLICARLE LOS PASOS Y PROCESOS QUE CONLLEVA LA MASTERIZACION Y CREO QUE NO HAYA NINGUN PROBLEMA EN ESO LUEGO DE HAY RECTIFICAS ALGUNAS COSITAS EN WAVELAB