Ostis, pues no tuve yo problemas ni na con mi AMD y la ISIS. Después de semanas peleándome contra el hardware de mi ordenador, llamé al servicio técnico de Guillemot, que me recomendó actualizar la versión de bios de mi placa.
Así lo hice y además me bajé la última versión de drivers de la ISIS, y empezó a funcionar (no perfectemente, pero sí aceptablemente).
Lo que es indudable es que AMD y Guillemot, lo que se dice compatible, no lo son.
Mira en el mezclador de la ISIS, ya no la tengo instalada pero recuerdo que en el último canal de la fila de arriba tienes el botón CD-Aux o algo así, actívalo y a ver si suena.
Lo que pasa cuando conectas el rack externo es que tienes sus salidas activadas pero la salida de la PCI puede estar desactivada en el mezclador.