No se puede hacer eso exactamente. Hay un programa que se llama Celemony Melodyne con el cual puedes tomar un archivo de audio monofónico (en la última versión creo que ya funciona el polifónco) y trocearlo para afinar sus partes nota por nota sin alterar los formantes. Una de las opciones que teda también es transformar el archivo a MIDI, aunque precisa después de mucha edición.
Gracias,Caramuxo,intentaré hacerlo con el Melodyne,a ver que tal.
Un saludo.