Yo diría que estás perdiendo los 3 dB's (de -3,6 en la entrada a -6,3 en la pista) por la configuración del "reparto estéreo" en Cubase ("Proyecto"/ "Configuración de proyecto"/ "Reparto estéreo"). Yo lo tengo puesto siempre a -3dB para mezclar, pero cuando quiero hacer mediciones de algún cacharro lo dejo a "0dB" para leer exactamente los valores que tengo en cada momento.
Los otros 0,6 dB's pues no sé como funciona esa tarjeta.
En mi caso (me ha picado la curiosidad y estoy ahora mismo haciendo lo mismo con mi peaso Focusrite Scarlett 2i4) tengo las dos salidas "buenas" conectadas a los monitores (cables balanceados y tal) y las salidas malas las tengo con un par de cables rca-jack que van a las dos entradas (con esta tarjeta es lo que hay). Con las entradas en modo "line" y sin aplicar el "pad" y con el control de ganancia al mínimo, una sinusoidal de 1KHz a -3dBFS me vuelve a -24,3dBFS (me pierde 21,3dB). El control de ganancia me puede subir la señal 50,1dB y el pad la baja unos 9,3dB.
Como dato extra (ya que estoy), el rango dinámico máximo que tengo es de unos 110dB y el mínimo de unos 80dB aprox. (con el control de ganancia de entrada de la tarjeta al mínimo y al máximo respectivamente, siempre en modo "line" y sin aplicar el pad).
Ya digo que no sé como funciona la Motu, pero recuerdo una anécdota con unos cables que no sé si tendrá algo que ver o no, pero como estoy medio aburrido la comentaré...
Resulta que hace un tiempo estaba preparando un proyecto usando una "M-Audio ProjectMix" como tarjeta y unos cables de marca "Rean" balanceados para los monitores. Pues resulta que empiezo a trastear una mezcla y al colocar la primera pista en el centro del panorama se me escuchaba más por un lado. Pensé que habría tocado algún botoncillo de los monitores por accidente o lo que sea. Total, sonómetro en mano, ruido rosa y calibro. Vuelvo a poner la pista en el centro y se escuchaba en el centro, empiezo a mezclar y al cabo de un rato noto que algo raro pasaba en el panorama, casualmente en un momento suave de la canción. Empecé a preguntarme si no me habría pasado con el café, si la tarjeta se había escoñao o si había tocado algo en los drivers, etc. ...
Pues resultó que uno de los cables estaba jodido (como mínimo), pero de una manera que yo no he visto nunca y que todavía hoy no llego a entender. Quité los cables y les empecé a hacer pruebas haciendo un loop usando la misma salida y la misma entrada para ambos cables. Uno de los cables (comparado con el otro), sonaba más bajo con señales bajas pero más alto con señales altas!!!!!!!!!!!!!
Así que cuando la mezcla sonaba alta el panorama se movía ligeramente a un lado y cuando llegaba un momento más tranquilo el panorama se movía al lado contrario (no mucho, era sutil, pero lo suficiente como para mosquear). Total, que fui a una tienda cualquiera y compré unos cables nuevos pero baratos, los puse, tuve que ajustar otra vez los monitores pero por lo menos los dos cables iban a la par (los medí) y por fin pude mezclar. Lo único que se me ocurre es que el cable chungo tuviera algún hilo roto por dentro y que de alguna manera tuviera problemas para conducir los voltajes más altos y dejase pasar bien los voltajes más bajos, pero vamos... Una paranoia...