Si, a partir de Pro Tools 9 ya se puede con tarjetas de terceros o ''third party'' siempre cuando sean ASIO o Core Audio
Buenas marcas :
Focusrite
SPL
MOTU etc
Saludos
En el foro hay mucha información al respecto, usa el buscador. Yo he puesto "pro tools cualquier interface" y salen muchas cosas
Un saludo