Controlar Pro Tools con la Ls9 no es posible.
Puedes usar los previos de la LS9 si los prefieres a los de la Digi003, y entrar en la Digi por analógico desde las omni out de la LS9 o por digital si la LS9 tiene alguna tarjeta de expansión con salida ADAT.
También puedes salir de la mesa en analógico, convertir a digital con el Alesis y entrar a la Digi por ADAT.
Pero vamos, no sé si te merecerá la pena los previos de la LS9 contra los de la Digi, haz una comparación primero antes de complicarte la vida.
Gracias. En todo caso usaría las tarjetas ADAT que tengo.