A ver, para empezar la Realtek HD integrada es "bastante cosa" para un uso doméstico. Ya vale de echar tierra encima de las tarjetas integradas, que son mucho mejores que lo que se dice y, a diferencia de muchas tarjetas externas o pci super fashion, la compatibilidad con el resto del sistema ya está garantizada, los drivers se actualizan a menudo y bien configuradas se pueden conseguir latencias bastante bajas.
Dicho eso, como yo también tengo una Realtek y Asio4All, a ver qué podemos sacar en claro. Entiendo que conectas la guitarra por la entrada de línea, así que abre el panel de Asio4All (supongo que desde Cubase puedes hacerlo en la configuración de audio). Dale al botón de la llave para abrir las opciones avanzadas. Marca las opciones Realtek HD Audio output (que ya debería de estarlo por defecto) y Realtek HD Audio Line Input (que seguramente no lo está). Si no estás usando entrada o salida óptica ni ninguna otra entrada o salida, desmarca lo que haya de más.
Cierra esa ventana, cierra la configuración de audio, guarda el proyecto que tengas en Cubase si es que tienes alguno abierto, cierra Cubase y vuelve a abrirlo. Abre de nuevo las opciones de Audio, y ahí el panel de A4A. Comprueba que las opciones que marcaste siguen ahí. Bien, si todo está correcto, ahora puedes mirar si te aparece la entrada de línea en la lista de inputs de Cubase. Ahora ya debería funcionar.
Decia lo que no son gran cosa, porque en la placa de mi hermano (que tiene unos 6 años ya), no se podía tocar porque aún con los asio, todavía dejaba algo de latencia que se notaba un poco y tuvo que pillarse una audiophile baratuna.
Bueno, la cosa es que ya se ha arreglado, aunque ha dado bastante guerra. Se ha solucionado cuando he abierto primero el amplitube a pelo y luego con el cubase.
Muchas gracias por la ayuda.