La misma situación, con un controlador Traktor x1 en midi, se asigna bien sin ningún problema. Esto mismo en Ableton y xone k2 tampoco hay ningún problema.
Bitwig tiene un editor de script que quizás desde ahi se pueda cambiar lo que manda la controladora por defecto o algún editor de midi que cambie la señal de NOTA a CC, pero ando algo perdido.