Es importante que conozcas un poco de varios, y ver con cual te acoplas mejor o en cual puedes encontrar mayor informacion para el aprendizaje de su uso (tutoriales, documentacion, etc.), yo te recomiendo principalmente 3, que son los que todos los profesionales usan para grabacion :
-Pro Tools
-Cubase
-Adobe Audition
y existen otros, pero como te comentaba, depende cual sea el que se adapte mas a ti, a tus conocimientos, y en cual conozcas mejor su uso..
espero haber podido ayudarte..
Puedes apoyarte aqui: http://www.produccionhiphop.com/cual-es-el-mejor-programa-de-audio/