Mira que llevo años trabajando con FL Studio y nunca había oído hablar de que hubiera una carpeta de backups.... ¿dónde está exáctamente?
Siento no poder resolver tu problema, a ver si alguien sabe, que también me interesa (lo que yo venía haciendo hasta ahora -dado que desconocía lo de la carpeta backup- era guardar los temas como v. 1, 2, 3, etc" las que hicieran falta, e ir trabajando siempre en la última, y cuando llegaba el momento de hacer cambios, entonces guardaba la v. anterior y creaba una nueva, y así sucesivamente hasta terminar el tema, y cuando ya está terminado, entonces borro todas las copias anteriores excepto la penúltima, por si acaso).
Si entendi bien las últimas modificaciones que hiciste en el proyecto back up no se guardaron, no? No sabria que decirte, pone que te muestre ordenado por fecha, te va a tirar el último proyecto que abriste