Buenas.
Supongo que lo que quieres es grabar una sesion de dj. Si es asi lo unico que tienes que hacer es grabar esa señal de audio dentro de una pista de Logic, seleccionando en el input del canal de entrada de la pista, el input 1-2 de la Traktor, que imagino que se conecta por USB al PC/MAC.
Tras esto, comienza a reproducir musica de la sesion para ver que entra la señal de audio. Despues de eso dale a grabar. La parte superior del logic se pondra roja y el boton rec aparecera resaltado. Tras esto deberia empezar a dibujarse la onda del sonido que estas grabando.
Cuando tengas las sesion, entonces tienes la opcion de hacer bounce de la pista (para por ejemplo pasarlo directamente a MP3), o guardar el proyecto y coger el sample que se ha grabado en la carpeta "Audio files" del proyecto de Logic.
Asi deberias conseguirlo.