solo hay que leerse un poco el manual, está todo ahí. Creo que lo que haces de ese modo es hacer una copia de todos los samples (y quizás más cosas) dentro de la carpeta del proyecto. Esto está bien si sueles modificar con frecuencia tus librerías de samples. Tampoco es mala idea usarlo cuando das por acabado un proyecto (ya que vete tu a saber que será de tus librerías dentro de 2 años) o para exportar proyectos de un ordenador a otro. O si trabajas con CD's de muestras...
Por otro lado recuerda que Live tiene un sistema para recuperar muestras extraviadas bastante eficiente, así que no te agobies mucho por este asunto.
saludos