Parece que nunca has utilizado un VSTi.
Por lo general los VSTis (lo que sale de el) no queda grabado a no ser que como entrada pongas un teclado o ingreses las notas una por una con el ratón.
Este VSTi actúa como caja de ritmos sincronizada con el host, es decir, le das play a Cubase y suena de acuerdo al tempo del DAW.
Si quieres grabar el audio que sale del VST debes crear un bus de salida, ese bus de salida meterlo como entrada de Audio a Cubase sin monitoreo (solo monitoreando el instrumento VSTi) y darle a play record desde la(s) pista(s) de audio a grabar.
Eso es todo.