Intenta cortarlos lo mejor posible, hasta que no "quede feo", le puedes aplicar un poco de reverb al FPC, y no se me ocurre que más...
Yo te recomiendo que no uses el FPC para samplear cualquier instrumento que no sea percusion.Yo el FPC solo lo usaria para eso..para percusion.
Prueba el Slicex,tiene mejores herramientas para trabajar los samples,para cortar,para hacer fade in/out...y para darle releases(que es lo que seguramente nesecites) o Decay.
Puedes probar a meterle tambien sutilmente algun efecto como reverb y delays..
Tambien esta el Directwaves para samplear,que ademas es muy bueno(aunque no se que FL tienes).
para samplear no hay nada mejor que el cool edit... guardas tu sample en wav y lo metes al flstudio asi le hago...