Hola!
En primero lugar gracias por lo de las canciones
Respecto a lo de que no te llega la señal... pues si antes ya habías trabajado con Nuendo y todo te funcionaba correctamente, no sabría decirte, quizá se haya estropeado el micro, o algo por el estilo, pero de todas maneras... eso de que conectas la guitarra directamente... no es muy adecuado e? Ya que, aparte de que estas metiendo un adaptador (de jack "grande" a jack "pequeño") si no me equivoco, la impedancia entre la salida de la guitarra y la entrada no son las mismas, y te va a sonar bastante mal...
Respecto al micro, quizá vayan por ahí los tiros :
¿Qué micro tienes? ¿Que guitarra? ¿Cómo conectas todo a la tarjeta interna de la placa base?
También de paso, comentarte, que sería recomendable que te comprases una tarjeta de sonido algo mejor, con mejores entradas y podrás arreglar muchos problemas, las hay muy baratitas y no tendras problemas de este tipo.
Bueno... contestame a lo que te pregunté a ver si puedo hecharte una mano!