Por fin... solucionado.
Por si alguien no lo sabe pues me explico...
1º- Abro el Nepheton en una pista midi y la salida la mando a un bus
2º- Abro una pista de audio y la entrada se la signo al bus que puse en la pista midi
3º- Monitorizo la pista de audio, le doy a la "R" y a grabar
Ami por lo menos me funcionó asi, si hay otra manera no la sé
Un saludo