Lo que estas preguntando realmente es mas cuestion de como tengas tu configuracion, que de Reason en si mismo.
Por lo que entiendo, tienes unas pistas grabadas en el Cool Edit y quieres agregar una nueva que la vas a grabar tocando en directo desde Reason y tu problema es que quieres oir el resto de pistas pero solo grabar la nueva de Reason. ¿Es correcto?.
Mejor que preguntes a alguien que sepa bien como configurar tu tarjeta de sonido para elegir la salida por la que enviar el sonido de Reason y la entrada por la que ha de grabar Cool Edit. Esa sera la solucion mas sencilla, pero yo no conozco el mezclador de tu tarjeta de sonido, y no puedo decirte como hacerlo.
Lo que te comento ahora es la solucion que yo haria en caso de "desesperacion". Simplemente pasaria toda la mezcla anterior de CoolEdit a un fichero wav y este fichero lo cargaria en un nuevo modulo de Reason del NN-19 (incluso a baja calidad, para que ocupe poco, es solo de referencia). Luego en Reason reproduciria la cancion desde el principio disparando la muestra del NN-19 anteriormente grabada nada mas empezar, e iria tocando y grabando las señales midi desde el teclado externo (no desde la pantalla de piano roll, que no te grabara lo que hagas).
Una vez terminado de tocar puedes editar lo que tocaste... luego exportar el sonido de Reason de la pista que has tocado (haciendo mute en la que cargaste en el NN-19) de manera que exporte solo lo que quieres llevar a CoolEdit. Y para finalizar cargar ese archivo wav en el CoolEdit.
De esta manera siempre podras guardar las distintas pistas que vayas grabando en Reason y no tendras que "improvisar" cada vez que quieras editar algo en una pista que ya grabaste.
No se si te servira mi solucion, pero por lo menos te aseguro que funciona.