Si el formato es correcto, que por lo que dices lo es, ¿no lo estaréis exportando en mono? Si no, no tiene sentido, algún parámetro de exportación no es el correcto.
si teneis el proecto a 24/48 y exportais a 16/44.1 si que se debe notar alguna diferencia...peor no lago como lo que dices, raro raro
A mi me pasaba y era por lo que dice Undercore. pero la diferencia es practicamente inapreciable. Se notaba mas en los agudos.