No estoy muy seguro pero, si ves bien el artículo:
http://musicalwars.blogspot.com/2007/08/guitar-link-ucg102.html
te darás cuenta de que la simulación del sonido se lleva a cabo bajo un software. Este está instalado en tu PC y procesa la señal "limpia" (sin ningún efecto ni modulación) y la regenera y modifica como tu le indiques.
Si bien no se si la señal que llega al PC por USB te permite extraerla a traves de otro programa, siempre podrás permitir que el software que tienes instalado no procese esa señal y obtenerla en limpio y tiempo real.
Bueno en tu caso como la saques del POD.
La verdad, habría que probarlo. Pero seguro que lo podrías usar para eso