Hola:
Te explico cómo hago yo
Para cambios y que no aparezcan como indicaciones previas, tanto en el compás como en la armadura tienes que ir a "mas opciones" cuando las cambies y marcar "ocultar" en el cambio de tonalidad y desmarcar "permitir advertencias" en el cambio de compás. En los cambios de clave ocultas con el inspector la de advertencia del ultimo compás del pentagrama anterior.
Para separar los pentagramas como si fueran independientes, selecciona la barra divisoria y pulsa "enter", para mantener los compases que necesites unidos selecciónalos y en MAQUETACIÓN>FORMATO elije "mantener juntos los compases", porque la maquetación automática te los puede separar.
Yo lo hago así, no sé si existe alguna forma más "científica"