Sí, solamente tienes que especificar qué es lo que quieres incluir al momento de exportar. Tienes cuatro opciones: Mix completo, Tracks separados, buses separados y salida de trarjeta (si tienes tarjeta con salidas múltiples, de otro modo no le veo mucho uso a esa opción).
En Buses no veo opcion de elegir entre Stereo o Mono (en ninguna, realmente, pues sólo puedes modificar eso a nivel global; o exportas todas en mono, stereo o split mono). Sin embargo, si alguna pista o Bus está en mono, aunque salga en estereo la señal será idéntica en ambos canales. No sonará stereo, sonará como si fuera mono, así que no le veo gran problema a eso, aunque siempre puedes exportar en split mono, pero para mí eso complicaría mucho el asunto.
Ahora que si haces varias exportaciones para cada tipo de archivo, pues sí que es posible hacerlo todo, aunque como digo, para mí son complicaciones innnecesarias.
La ventana export audio, es muy completa y estan todas las opciones.
. Vale la pena echarle una mirada detenida