A mi me paso una vez algo parecido (solo parecido)
Abri el pc y le quité todo a la placa, procesador, memoria, gráfica, y todo lo que había en los PCI.
Después puse todo otra vez y desapareció el problema.
Se que la respuesta es una tontería, pero a mi me funcionó.
eso es normal que pase cuando la temperatura del micro, chipset se pasa de los valores normales y se sobrecalienta, comprueba la temperatura, chequea que la CPU este en contacto con el disipador y entre estos dos si hay un minimo de pasta termica de alguna clase, que los ventiladores de la CPU y de los chipset esten funcionando
si las temperaturas estan bien, entonces ya puede ser cualquier cosa.