No, no es raro, pasa todo el tiempo. Muchos programas, especialmente los más antiguos, añaden mensajes (que algunos podrían ser sysx, pero no necesariamente). Muchos secuenciadores actuales lo hacen de manera diferente, y casi siempre son más fácil de verse. No en el caso de esos, que se encuentran normalmente insertados en las mismas pistas, como eventos MIDI.
No sé en Ableton Live cómo se podrán ver, pero en otros DAW's (secuenciadores) como en Sonar, se les llama eventos, (como casualmente, las notas son también eventos) y sólo se pueden ver en la ventana de....exactamente, eventos. En Ableton debe haber algo similar, que te deje verlos. La idea es borrarlos, ya que en la mayoría de los casos ya no son necesarios y están estorbando. El 90% de archivos MIDI rondando por la red los tiene.
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Gracias por la info stix, ahora solo falta averiguar donde puedo borrar el dichoso "evento", gracias.