Hola,
¿Como estás abriendo el archivo midi en Sonar? Lo suyo es que abras Sonar y después abras el archivo midi como si de un proyecto se tratase (Archivo/Abrir/doble click en archivo midi).
A parte de eso puede ser que estés abriendo un archivo en formato mid0, el cual concentra toda la info midi en un solo track cuando comparten salida midi...aunque Sonar creo que los abre en pistas independientes...no lo sé a ciencia cierta.
Por último revisa el Gestor de Pistas (tecla M) para ver si tienes las pistas ocultas.
Saludos,
